La gestión del proyecto está a cargo de la UCP, tanto en lo referido a las labores de administración, finanzas, contabilidad, como a la coordinación de los aspectos técnicos. En tanto que el desarrollo de las actividades orientadas al propósito del Programa, serán ejecutadas en coordinación con los órganos técnicos del MINSA y sus Organismos Públicos Descentralizados – OPDs.

La Unidad Coordinadora (UCP) es el órgano de gestión del PROGRAMA, que reporta orgánicamente al Viceministro de Salud. Su finalidad es la de supervisar y coordinar la ejecución de las actividades del Programa, como el realizar toda la labor administrativa (contable, financiera y de adquisiciones), así como las labores de monitoreo y evaluación.

La organización de la UCP del programa se aprecia en el diagrama siguiente:

La gestión del PARSALUD II, se mantendrá a través de la Unidad Coordinadora del Programa – UCP del PARSALUD II en lo referido a las labores de administración, finanzas, contabilidad y la coordinación de los aspectos técnicos. En tanto que el desarrollo de las actividades orientadas al propósito del PROGRAMA serán responsabilidad de los órganos técnicos del MINSA y sus Organismos Públicos Descentralizados – OPDs. Para tal efecto la UCP es una Unidad Ejecutora – UE 123 del Pliego 011 MINSA, independiente administrativa y financieramente de la Administración Central del MINSA (Oficina General de Administración – OGA, UE 001).

Las funciones específicas de la UCP son las siguientes:

1. Supervisar la ejecución del Plan de Acción del PARSALUD II.
2. Ejecutar diligente y oportunamente los recursos financieros asignados al PARSALUD II.
3. Cumplir y hacer cumplir las normas generales de los bancos financiadores y supletoriamente las normas nacionales.
4. Coordinar con las autoridades nacionales (MINSA y MEF principalmente), con las autoridades regionales y con los funcionarios de los Bancos financiadores para el cumplimiento de sus objetivos programáticos y financieros.
5. Presentar oportunamente los informes técnicos y financieros contables que den cuenta al MINSA, al MEF, a los Bancos y al Sistema Nacional de Control el cumplimiento estricto de las normas vigentes.

El Comité Directivo del PARSALUD II - CDP toma todas las decisiones estratégicas que se requieran y vigila la eficiente ejecución del PARSALUD II. La conformación del Comité Directivo del PARSALUD II  es la siguiente:

• Un Representante Ministerio de Salud – MINSA.
• Un Representante Ministerio de Economía y Finanzas - MEF.
• Un Representante de los Gobiernos Regionales que intervienen en PARSALUD II
• El Coordinador General del PARSALUD II, que actuará de secretario del Comité Directivo, con voz pero sin voto.